Что лучше обрушатся к счетчику 82С54, отвечающий за Time of Day, напрямую по портам или использовать ClockCycles()?
В общем случае, использовать сервисные функции ОС, например, ClockCycles(), предпочтительнее, чем обращаться к аппаратуре напрямую.
Добавлю, что функция ClockCycles() работает с аппаратным счетчиком тактов процессора, а не с таймером.