Если это ваше графическое приложение, то можно до отображения окна сбросить флаг Ph_WM_TASKBAR в Pt_ARG_WINDOW_MANAGED_FLAGS.
Примерно так
...
PtArg_t args[1];
...
PtSetArg( &args[0], Pt_ARG_WINDOW_MANAGED_FLAGS, !Ph_WM_TASKBAR, Ph_WM_TASKBAR );
PtSetResources( ABW_base, 1, args );
...