Проблема с запуском NDK после установки из-под "русской" учетной записи действительно существует. Но вообще, при установке инструментального ПО лучше не использовать символы кириллицы ни в путях, ни в именах учетных записей. Например,
вот в этой ветке можно об этом прочитать несколько слов (последний пост). Так что на данный момент решением может быть установка и работа с NDK из-под учетной записи, содержащей в названии только латинские символы.