Здравствуйте!
Пробовали ли Вы подключать USB-flash накопители в разъем USB 2.0? Устройства появляются в выводе утилиты usb -vvv?
Запустите io-usb с параметрами -dehci -dohci -duhci -vvvvv и пришлите нам вывод следующих утилит:
# pidin arg
# pidin mem
# pidin irq
# sloginfo
# pci -vvv
Также, возможно, поможет отключение режима XHCI в BIOS'e, если такой присутствует.